"Złoty Kompas" to adaptacja pierwszej części sagi Philipa Pullmana zatytułowanej "Mroczne materie". W samym sercu angielskiego Oksfordu dorasta osierocona przez rodziców dziewczynka imieniem Lyra. W jej świecie, równoległym do naszego, magia, nauka i teologia są ze sobą ściśle powiązane, a każdy człowiek posiada własnego towarzysza, połączonego z nim niedziwialną więzią - dajmona. Lyra wiedzie spokojne życie, aż do czasu, kiedy najbliższy jej przyjaciel, chłopiec kuchenny imieniem Roger z kolegium, w którym dziewczynka się wychowuje zostaje porwany, przez postacie, zwane przez wszystkich ..